U ovom trenutku nije poznato koji tip transplantacije je najbolja strategija za folikularni limfom. Obje strategije imaju relativno dobre rezultate. Korištenje vlastitih matičnih stanica uključuje niži potencijal za nuspojave i može dugotrajno kontrolirati bolest. Ako se vaša bolest ponovi nakon presađivanja vlastitih stanica (nazvanih autolognim transplantacijama), možda ćete moći probati drugi transplantaciju pomoću stanica vaše sestre (nazvane alogenijskim transplantacijama). Allogene transplantacije nose rizik od bolesti graft versus host, pri čemu strane imunološke stanice napadaju novog domaćina. Svrha transplantacije je da vam pomogne da se oporavite od kemoterapije koja se daje za liječenje limfoma.
